Comprometido con la ciencia de datos y la bioinformática , con habilidades en Numpy , Pandas , Matplotlib , Seaborn , Scikit-learn , Pytorch , Tensorflow , Keras , LIME , Prince . Experiencia en ingeniería de software con FastAPI , Docker , Nextflow , HPC . Conocimientos en Python , SQL , R , Matlab . Multilingüe : Español , Inglés y Francés
Construí árboles filogenéticos, realicé minería y validación de genes para localizar genes relacionados con funciones específicas en el genoma y el transcriptoma. Automatización de análisis bioinformáticos y filogenéticos utilizando scripts de Python y Nextflow.
Logro principalRealicé análisis bioinformáticos exhaustivos de datos transcriptómicos y genómicos derivados de muestras de peces.
Asesoré sobre comprobaciones de calidad, ensamblaje y anotación de genomas bacterianos. Impartí sesiones prácticas sobre ingestión de datos del NCBI, uso de HPC y técnicas de transferencia de datos.
Logro principalColaboré con un profesor para formar a estudiantes en análisis genómico en la sección final de un curso de genética.
Realicé ingeniería de características para extraer características genómicas mediante ensayos bioinformáticos y filogenéticos. Empaqueté el modelo como una interfaz lista para la producción usando Docker y FastAPI.
Logro principalDesarrollé un modelo de aprendizaje automático para predecir el riesgo de hospitalización y mortalidad por SARS-CoV-2 a partir de datos genómicos, demográficos y clínicos.