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ValueError: el tamaño de numpy.ndarray cambió, puede indicar una incompatibilidad binaria. Se esperaba 88 del encabezado C, obtuve 80 de PyObject

Importar desde pyxdameraulevenshtein da el siguiente error, tengo

 pyxdameraulevenshtein==1.5.3, pandas==1.1.4 and scikit-learn==0.20.2. Numpy is 1.16.1. Works well in Python3.6, Issue in Python3.7.

¿Alguien ha tenido problemas similares con Python3.7 (3.7.9), imagen de la ventana acoplable - python:3.7-buster?

 __init__.pxd:242: in init pyxdameraulevenshtein ??? E ValueError: numpy.ndarray size changed, may indicate binary incompatibility. Expected 88 from C header, got 80 from PyObject
over 4 years ago · Santiago Trujillo
3 Respuestas
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Estoy en Python 3.8.5. Suena demasiado simple para ser real, pero tuve el mismo problema y todo lo que hice fue reinstalar numpy. Desaparecido.

 pip install --upgrade numpy

o

 pip uninstall numpy pip install numpy
over 4 years ago · Santiago Trujillo Denunciar

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intente con numpy==1.20.0 esto funcionó aquí, aunque otras circunstancias son diferentes (python3.8 en alpine 3.12).

over 4 years ago · Santiago Trujillo Denunciar

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De hecho, (construir e) instalar con numpy>=1.20.0 debería funcionar, como se señala, por ejemplo, en esta respuesta a continuación . Sin embargo, pensé que algunos antecedentes podrían ser interesantes y proporcionar también soluciones alternativas.

Hubo un cambio en la API de C en numpy 1.20.0 . En algunos casos, parece que pip descarga la última versión de numpy para la etapa de compilación, pero luego el programa se ejecuta con la versión instalada de numpy . Si la versión de compilación utilizada es <1.20 , pero la versión instalada es =>1.20 , se producirá un error.

(Al revés, no debería importar, debido a la compatibilidad con versiones anteriores. Pero si uno usa una versión instalada numpy<1.20 , no anticiparon el próximo cambio).

Esto lleva a varias formas posibles de resolver el problema:

  • actualizar (la versión de compilación) a numpy>=1.20.0
  • use la versión numpy admitida mínima en pyproject.toml (old oldest-supported-numpy )
  • instalar con --no-binary
  • instalar con --no-build-isolation

Para obtener una discusión más detallada de las posibles soluciones, consulte https://github.com/scikit-learn-contrib/hdbscan/issues/457#issuecomment-773671043 .

over 4 years ago · Santiago Trujillo Denunciar
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