No hay diferencia. De los documentos :

mockFn.mockImplementation(fn)

Acepta una función que debería usarse como implementación del simulacro. El simulacro en sí seguirá registrando todas las llamadas que entran y las instancias que provienen de él mismo; la única diferencia es que la implementación también se ejecutará cuando se llame al simulacro.

Nota: jest.fn(implementation) es una forma abreviada de jest.fn().mockImplementation(implementation) .