InfrastructureR_0.1.4.tar.gz es un paquete fuente R que creé usando RStudio en Windows y funciona bien. Pero cuando trato de usarlo en el archivo docker con el comando InfrastructureR_0.1.4.tar.gz se encuentra en la misma ubicación que el archivo Docker
Docker se ejecuta en una máquina ubuntu 18.x
RUN R -e "install.packages('InfrastructureR_0.1.4.tar.gz', dependencies=FALSE, verbose=TRUE, repos=NULL, type='source')" no se instala.
Ejecuto la compilación docker por sudo docker build -t myRApp s . y me sale el siguiente mensaje de error
Installing package into '/usr/local/lib/R/site-library' (as 'lib' is unspecified) system (cmd0): /usr/lib/R/bin/R CMD INSTALL Warning: invalid package 'InfrastructureR_0.1.4.tar.gz' Error: ERROR: no packages specified Warning message: In install.packages("InfrastructureR_0.1.4.tar.gz", dependencies = FALSE, : installation of package 'InfrastructureR_0.1.4.tar.gz' had non-zero exit statusEntonces, ¿cómo instalo un paquete fuente R personalizado en Docker?
No es suficiente tener su archivo tar.gz en el mismo directorio que su Dockerfile. Para hacer que un archivo local esté disponible para un contenedor Docker creado a partir de una imagen, puede usar la instrucción COPY .
La instrucción COPY copia nuevos archivos o directorios desde <src> y los agrega al sistema de archivos del contenedor en la ruta <dest> :
COPY [--chown=<user>:<group>] <src>... <dest>Más en los documentos de la ventana acoplable:
Creo que el paquete debe copiarse dentro del contenedor para que el contenedor pueda acceder a él. (o en un volumen de ubicación al que tiene acceso Docker)
R que se ejecuta dentro del contenedor no puede encontrar el archivo.