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sqlite3.OperationalError: la base de datos está bloqueada (phyluce)

Actualmente, estoy ejecutando phyluce y tratando de hacer coincidir mis contigs con sondas diseñadas. He ejecutado el código particular (phyluce_assembly_match_contigs_to_probes) varias veces con mis propios datos y todo funciona bien, excepto por ahora. Cada vez que intento ejecutar este fragmento de código, aparece el problema 'sqlite3.OperationalError: la base de datos está bloqueada'. He tratado de averiguar qué base de datos está bloqueada, pero cuando miro en sqlite3, no hay bases de datos para encontrar. Además, no puedo rastrear ningún 'archivo bloqueado oculto' en ninguno de los directorios.

¡Cualquier ayuda sobre cómo resolver este problema sería muy apreciada!

 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - ======= Starting phyluce_assembly_match_contigs_to_probes ======= 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Version: 1.7.1 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Commit: None 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --contigs: /USER/SNP_calling/contigs 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --csv: None 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --dupefile: None 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --keep_duplicates: None 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --log_path: None 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --min_coverage: 85 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --min_identity: 85 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --output: /USER/SNP_calling/uce-search-results 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --probes: /USER/SNP_calling/uce-20k-probes.fasta 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --regex: ^(uce-\d+)(?:_p\d+.*) 2022-01-24 18:23:35,327 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Argument --verbosity: INFO 2022-01-24 18:23:35,470 - phyluce_assembly_match_contigs_to_probes - INFO - Creating the UCE-match database Traceback (most recent call last): File "/home/User/miniconda3/envs/phyluce-1.7.1/bin/phyluce_assembly_match_contigs_to_probes", line 421, in <module> main() File "/home/User/miniconda3/envs/phyluce-1.7.1/bin/phyluce_assembly_match_contigs_to_probes", line 305, in main log, os.path.join(args.output, "probe.matches.sqlite"), organisms, uces File "/home/User/miniconda3/envs/phyluce-1.7.1/bin/phyluce_assembly_match_contigs_to_probes", line 129, in create_probe_database c.execute(query) sqlite3.OperationalError: database is locked```
over 4 years ago · Santiago Trujillo
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