En la celda de un Notebook escriba y ejecute el código:

 import sys !{sys.executable} -m pip install --user matplotlib

y recargar el kernel

(fuente: http://jakevdp.github.io/blog/2017/12/05/installing-python-packages-from-jupyter/ )

abra la terminal y cambie el directorio a la carpeta Scripts donde se instaló python. Luego escriba el siguiente comando y presione enter

 pip install matplotlib

Espero que esto resuelva el problema.

Estaba enfrentando el problema exacto. Resulta que estaba usando la versión Python del sistema a pesar de que yo había activado mi entorno virtual.

Esto es lo que finalmente funcionó.

Si está utilizando un entorno virtual que tiene un nombre, digamos myvenv , primero actívelo usando el comando:

 source activate myvenv

Luego instale el módulo ipykernel usando el comando:

 pip install ipykernel

Finalmente ejecute (cambie myvenv en el código a continuación al nombre de su entorno):

 ipykernel install --user --name myvenv --display-name "Python (myvenv)"

Ahora reinicie el portátil y debería recoger la versión de Python en su entorno virtual.