No tiene nada que ver con la codificación. Si el texto incluye los caracteres con los puntos de código 2 y 7, no se pueden incluir en un documento XML 1.0. (Parece que su herramienta de conversión ignora los caracteres que no son válidos en XML, otras herramientas pueden arrojar un error o encontrar alguna otra forma de representarlos, por ejemplo, como una instrucción de procesamiento <?char 2?> ).
XML 1.1 permite estos puntos de código, pero XML 1.1 no es ampliamente compatible.