Resolví esto copiando la estructura de una dependencia de jQuery en resources/Resources.php con el recurso que quería incluir y subí el archivo .js a la carpeta especificada.
Luego agregó el siguiente código a LocalSettings.php :
$wgHooks['BeforePageDisplay'][] = function( OutputPage &$out, Skin &$skin ) { $out->addModules('mymodule'); return true; };