Reproduciendo el problema
Esto se puede ver en la página de Uso básico de Select2, que es de donde proviene este gif. 
Soluciones tentativas
Sé de una "solución" , pero requiere que coloque cada llamada select2 dentro de un oyente window.onpageshow .
Esta solución es de mano dura y no aborda el problema real con el marcador de posición/opciones inicializadas que reemplazan la opción seleccionada en la carga de la página.
Conclusión
Estoy buscando una respuesta más concluyente a este problema, enfocándolo en la fuente. ¿Alguien puede ayudarme a identificar qué css/js anular para remediar este reemplazo de marcador de posición de la opción seleccionada en la carga de la página?
Gracias por leer.