Tienes que dividir el gran problema en problemas más pequeños.

Primero, necesitas obtener la duración de tu video :

 var vid = document.getElementById("myVideo"); duration = vid.duration;

A continuación, debe obtener la cantidad de desplazamiento en porcentaje

 function getVerticalScrollPercentage (elm) { var p = elm.parentNode return (elm.scrollTop || p.scrollTop) / (p.scrollHeight - p.clientHeight ) * 100 }

A continuación, debe configurar dinámicamente el tiempo actual de su video (en segundos), puede hacerlo de esta manera:

 vid.currentTime = duration * percentage / 100;

Y finalmente, debe configurar el tiempo actual nuevamente, cada vez que cambie la cantidad de desplazamiento. Eso se logra mediante el uso de un detector de eventos, en el body , por ejemplo.

 object.addEventListener("scroll", myScript);

Ahora ponlo todo junto :)