Parece que tiene una matriz de cadenas donde las cadenas son valores de bytes escritos como cadenas hexadecimales. Así que necesitas:

• Convierta cada cadena hexadecimal en un byte; eso se hace fácilmente con parseInt(str, 16) (el 16 es hexadecimal). parseInt permitirá el prefijo 0x . O podría usar +str o Number(str) ya que el prefijo está ahí para decirles qué base numérica usar. (Más sobre varias formas de convertir cadenas en números en mi respuesta aquí ).
• Cree un búfer y rellénelo con los bytes.

Si la matriz no es enorme y puede crear felizmente una matriz temporal, use map y Buffer.from :

 const buffer = Buffer.from(theArray.map(str => +str)));

Si desea evitar matrices intermedias innecesarias, me sorprende no ver ninguna variante de Buffer.from que permita el mapeo, por lo que tenemos que hacer esas cosas por separado:

 const buffer = Buffer.alloc(theArray.length); for (let index = 0; index < theArray.length; ++index) { buffer[index] = +theArray[index]; }