Compruebe en Ventana -> Preferencias -> General -> Editores -> Asociaciones de archivos. Para el tipo de archivo *.js, seleccione cualquier editor de secuencias de comandos relevante como predeterminado (por ejemplo, JS Editor) en la ventana de editores asociados y aplíquelo.

Si *.js no está presente en los tipos de archivo, agréguelo y seleccione Editor JS como predeterminado en el panel Editores asociados.