Había que solucionar cuatro problemas:

• El nombre de la imagen debe incluir el formato png para este caso
• La respuesta debe estar en el formato correcto como un búfer para una imagen
• Debe escribir los datos de respuesta y no el objeto en sí
• __dirname solo necesita dos guiones bajos

 const rawGitLink = "https://raw.githubusercontent.com/cardano-foundation/CIPs/master/CIP-0001/CIP_Flow.png" const folder = "/Folder" const imageName = "/Test.png" const imageResponse = await axios.get(rawGitLink, { responseType: 'arraybuffer' }); fs.writeFileSync(__dirname + folder + imageName, imageResponse.data)

Axios devuelve un objeto especial: https://github.com/axios/axios#response-schema

 let {data} = await axios.get(...) await fs.writeFile(filename, data) // you can use fs.promises instead of sync

Como dijo @Leau, debe incluir la extensión en el nombre del archivo. Otra sugerencia es usar el módulo de path para crear el nombre del archivo:

 filename = path.join(__dirname, "/Folder", "Test.png")