Ok, después de hacer algunas investigaciones, parece que la diferencia es si el error ocurre en node_modules o no. Si el error se produce dentro de la raíz del proyecto, jest imprimirá un bonito mensaje con un puntero a la línea que causó el error. Pero si el error ocurre dentro de la carpeta node_modules , Jest imprimirá el mensaje de error junto con el seguimiento de la pila, sin ningún indicador visual.