Si revisa la documentación para informes en pytest-cov, puede ver cómo manipular el informe y generar versiones adicionales.
Por ejemplo, al agregar la opción --cov-report term-missing obtendrá las líneas que faltan impresas en la terminal.
Una opción más fácil de usar sería generar un informe html mediante el uso de la opción --cov-report html . Luego puede navegar a la carpeta generada ( htmlcov por defecto) y abrir index.html con su navegador y navegar por su código fuente donde se resaltan las líneas que faltan.
Además de la respuesta de Ignacio , también se puede configurar show_missing = true en .coveragerc , ya que pytest-cov también lee ese archivo de configuración.