Pude hacer coincidir todo lo que estaba fuera de los corchetes usando ([^\[\]]+)(?:$|(?=\[)) , lo que me da:

!Bat_Boy.png|thumbnail! !visagepaume.png|thumbnail!, Test comment: public., Test comment: internal., [^TEST_ATTACHMENT.txt] , Test comment: public!, !visagepaume.png|thumbnail!, Test comment: internal!, [^TEST_ATTACHMENT .TXT]

¿Hay alguna manera de escribir una sola expresión regular que también coincida fuera de dos signos de exclamación con una tubería en el medio, además? Esto se debe usar con un solo método de cadena java replaceAll(). Básicamente, estoy buscando este resultado:

!Bat_Boy.png|miniatura! !visagepaume.png|miniatura! , Test comment: public., Test comment: internal., [^TEST_ATTACHMENT.txt] , Test comment: public!, !visagepaume.png|miniatura! , Test comment: internal!, [^TEST_ATTACHMENT.txt]

Notas:

• Incluyo la tubería intermedia como un requisito principalmente porque podría haber signos de exclamación en esos "comentarios de prueba", y pensé que tal vez esto ayudaría.
• ¡No creo que deba preocuparme por anidar [] o !