Tengo dificultades para llevar mi aplicación de reacción a su propio repositorio en github. Tengo un proyecto que se ejecuta en localhost: 5000 y cuando lo presiono en github, comparte la misma carpeta con otro proyecto con localhost: 3000 (el puerto predeterminado para reaccionar es 3000. La aplicación en el puerto: 5000 termina compartiendo el mismo repo/carpeta con la aplicación en el puerto: 3000), y cuando publico en las páginas de github, aparece el otro proyecto originalmente en localhost: 3000.

¿Cómo hago que el proyecto en el puerto: 5000 exista como un repositorio (no comparta la misma carpeta que el proyecto en la publicación: 3000)

Cualquier ayuda servirá